Gabrielė Gardzijauskaitė, Guoda Žukienė
Abstract
Makšties mikrobiomas yra svarbus palaikant makšties gleivinės homeostazę, vietinius imuninius atsakus ir moters reprodukcinę sveikatą. Tradiciniai mikrobiomo tyrimų metodai daugiausia orientuoti į mikroorganizmų taksonominę sudėtį, tačiau vis daugiau duomenų rodo, kad klinikinė reikšmė glaudžiai susijusi su mikrobiomo funkcine veikla. Šioje apžvalgoje aptariamas multiomikos metodų – metagenomikos, metatranskriptomikos, metaproteomikos ir metabolomikos – taikymas makšties mikrobiomo tyrimuose, pabrėžiant jų reikšmę disbiozės, uždegiminių procesų ir onkoginekologinių būklių, įskaitant ŽPV sukeltas gimdos kaklelio patologijas, vystymuisi. Apžvelgiami tyrimai rodo, kad mikrobiomo funkciniai rodikliai, tokie kaip genų raiška, baltymų ir metabolitų profiliai, dažnai tiksliau atspindi makšties mikroaplinką nei vien taksonominė mikroorganizmų sudėtis. Ypatingas dėmesys skiriamas metabolitų ir imuninių žymenų sąsajoms su makšties pH, gleivinės uždegimu ir tokių ligų, kaip ŽPV infekcijos, progresavimu. Taip pat aptariami pagrindiniai multiomikos metodų taikymo klinikinėje praktikoje iššūkiai, įskaitant didelį mikrobiomo kintamumą, duomenų analizės sudėtingumą ir standartizacijos trūkumą. Apžvalgoje pabrėžiama, kad integruota multiomikos analizė sudaro svarbų pagrindą kliniškai reikšmingų biožymenų identifikavimui ir individualizuotos medicinos vystymui ginekologijoje.
Keyword(s): makšties mikrobiomas, multiomika, metagenomika, metaproteomika, metabolomika.
Full Text: PDF